Фотошоп - это, в первую очередь, редактор растровой графики. Про анимацию в нем, если честно, слышу впервые (я пользую 9-ку). Для редактирования изображений, и оптимизации их для Флеш - просто незаменимый инструмент для винды. В фотошопе можно неплохо фотомонтажить, дизайнить html страницы и многое другое.
А Флеш - это Флеш. Во-первых вектор по определению весит намного меньше. Потом эта программа создана для анимации. Но самое главное - это возможности Action Script. Интерактивность, интерактивность и еще раз она! И все зависит от поставленных задач. А вообще анимацию даже с помощью блокнота можно делать (обычного бумажного)