Не понимаю как такое вообще может быть. Что-то я не знаю, видимо, про настройки стэнделон ФП.
У нашей сотрудницы дома, ФП открывает все файлы swf в полноэкранном режиме! Хотя в самих swf никаких команд на это нет (в некоторых вообще нет кода!). На всех других компах работает ожидаемо - в нужный размер.
Монитор на "странном" компе имеет гигантское разрешение: 1920х1200, ФП 9.0 r115

Как теперь жить?

 если ОС виндоус - попробуй посмотри в реестре HKEY_CLASSES_ROOT\.swf через какую программу открывает и не дописывает ли какие нибудь строчные команды. Возможно у flashplayer.exe есть параметр для запуска типа 

flashplayer.exe -fullscreen (только такой я не нашел 

Или на крайний случай обновить флеш-плеер.

Больше вариантов я не вижу.

У меня к этому компу нет доступа 
Просто хочу повторить эффект и понять как такое в принципе возможно. Про параметр при запуске я подумал, но только тоже нигде про это не слышал.